El Secretario General será designado por el Consejo de Jefas y Jefes de Estado y de Gobierno.
Ejercerá sus funciones durante dos años, renovable solo por una vez y no podrá sucederle una persona de la misma nacionalidad.

El Secretario General es el representante legal de la Secretaría General de UNASUR, no solicita ni recibe instrucciones de ningún Gobierno, ni entidad ajena al organismo.